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中华医学会杂志社（《中华医学杂志》社有限责任公司，以下简称“杂志社”）是以编辑出版中华医学会主办的各类医学期刊为主要任务的全国性医学期刊出版机构。截至目前，中华医学会主办的医学期刊已达147种，形成了国内医药卫生界数量最多、影响最大、权威性最强的医学期刊集群。杂志社也成为目前国内最大且最具影响力的医学专业杂志社。

杂志社设有办公室、总编室、财务室、出版部、新媒体部、市场营销部、党工部、各期刊编辑部等部门。中共中华医学会杂志社党总支拥有50多名党员，下设4个支部。总社直接编辑出版29种纸质期刊和1种网络期刊，同时对中华医学会主办，委托省市医学会、医学院校、科研院所编辑出版的100余种委托期刊进行编辑出版管理。